Eugene Chaucer
Dołączył: 30 Lis 2019
Posty: 3
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 Wysłany: Sob Lis 30, 2019 07:23 Temat postu: chaussures puma |
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Schneider et Excoffier, 1999) avec Arlequin. De plus, nous avons chaussures puma utilisé le programme Beast 1.6.1 (Drummond et Rambaut, 2007) pour estimer les temps de coalescence et la démographie passée. Nous avons défini le meilleur modèle de substitution de nucléotides pour notre ensemble de données, à savoir le modèle G de HKY (Hasegawa et al., 1985), à l'aide du critère d'information Akaike (AIC, Akaike, 1974) mis en Suvre dans jModelTest 0.1 (Posada, 2008).
La deuxième série d analyses de Beast visait à déduire l époque de l ancêtre commun le plus récent (t MRCA) de différents groupes d échantillons, ainsi qu à reconstituer l historique démographique des pumas en estimant les fluctuations passées de la puma suede noir taille de la population via le tracé bayésien de la Skyline ( BSP) (Drummond et al., 2005). Nous avons supposé un arbre Bayesian Skyline avant et une horloge moléculaire stricte, dont le taux d'évolution était basé sur l'estimation claquette puma tirée de la première série d'analyses.
Des niveaux modérés à élevés de diversité d'haplotypes ont été observés, tandis que la diversité de nucléotides était plutôt faible (tableau 2).Réseaux de jonction médian basés sur les haplotypes puma ND5. L'aire de chaque cercle est proportionnelle à la fréquence de l'haplotype. La fréquence relative des populations dans chaque haplotype est indiquée par la proportion de couleurs différentes (codée comme à la figure 1). A) Analyse de l'ensemble complet de chaussure puma femme données (669 pb).
La flèche indique le point où le groupe externe P. yagouaroundi est connecté. B) Analyse d'un sous-ensemble des sites de nucléotides qui chevauchent la séquence de Miracinonyx trumani (286 pb). Les flèches indiquent les points où les taxons du sous-groupe rejoignent le réseau: P. yagouaroundi (en gris; 32 étapes mutuelles à partir du point de connexion) et M. trumani (en noir; 19 étapes à partir du point de connexion).
Lorsque les séquences de P. yagouaroundi étaient utilisées en tant que groupes externes dans le réseau (figure 2A), elles étaient reliées par 85 étapes mutationnelles à l'haplotype H01 de puma, supportant cette position pour la racine de puma mn. L'haplotype H01 se trouve dans le centre de l'Amérique du Sud (le Paraguay, ainsi que dans les États brésiliens puma suede platform MS, SP et MG), se différenciant par au moins six étapes mutationnelles des principaux haplotypes d'Amérique du Nord et d'Amérique centrale.
L Amérique centrale était mieux représentée en deux groupes distincts, nord et sud, le premier étant fusionné avec l Amérique du Nord. Dans le meilleur scénario à deux niveaux (voir tableau 3), nous avons également noté que les valeurs sc et ct étaient respectivement égales à 0,41904.Des estimations par paires de st ont été réalisées aux différentes échelles spatiales testées dans ces scénarios et ont permis d'évaluer le caractère [img]http://www.setteottavi.com/images/chaussure/puma suede platform-558vgt.jpg[/img] distinctif des unités de population à grande échelle et régionales. |
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Aliladla
Dołączył: 23 Lip 2024
Posty: 3511
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